新三板全面深化改革的启动，再加上创业板改革并试点注册制渐行渐近以及未来区域股权市场制度创新试点的推进，多层次资本市场体系各板块的定位将更为清晰，相互联系将更加畅通，“多层次”含金量将得到显著提升。
历经近30年发展，多层次资本市场体系初步形成，但也面临“塔基”有效性未充分激活、各板块定位未完全厘清和多层次有机联系不畅等短板。在证监会提出的全面深化资本市场改革12大重点任务中，补齐多层次资本市场体系短板是重要内容。其中包括推进创业板改革，加快新三板改革，选择若干区域性股权市场开展制度和业务创新试点。
多层次体系各板块定位更加清晰，有利于优势互补，进一步激发服务中小企业能力。新三板改革方面，一是要与交易所市场错位发展。新三板主要服务于创新型、创业型的成长性中小企业和民营企业，创业板主要服务于具有相当规模和成长性的创新型企业，科创板主要服务于符合国家战略的、市场认可度较高的优质科创企业。从覆盖面上讲，新三板、创业板、科创板依次缩减，分别覆盖89个、50个行业大类和数个高新技术产业或战略性新兴产业。二是要发挥承上启下作用。一方面，新三板通过各类差异化监管措施促进挂牌企业规范治理、信披合规，为创业板、科创板培育优质上市资源；另一方面，新三板是上市公司子公司挂牌的重要场所，也是上市公司发掘并购标的的公开市场。截至今年6月，累计有135家挂牌企业被上市公司收购，占新三板市场收购金额比重的65%。
多层次体系各板块的互联互通关系更加畅通，有利于发挥合力，提升“多层次”体系含金量。此次新三板改革的核心是建立新三板挂牌公司转板上市机制，既稳定挂牌企业预期，打通其上升通道，又提升资本市场效率，避免重复监管和降低企业运营成本。由此，新三板的“苗圃”作用将有新的定义，“精选层-创新层-基础层”的市场结构，特别是精选层挂牌企业约等于上市公司的定位，将有利于激活新三板在区域股权市场、交易所市场的衔接作用。
未来，多层次体系“补短板”举措还将陆续出台。在创业板十周年之际，创业板多方面改革酝酿已久，呼之欲出。特别是注册制稳步推行的第一站就是创业板，这将进一步增强创业板对创新创业企业的包容性。私募股权投资方面，政策暖风频吹，监管层正研究股权和创投基金管理人利用多层次资本市场融资的方式和路径，推动完善私募股权基金税收政策。
资本市场改革已步入密集“施工期”，各项举措相互联系，有机统一。可以预期，多层次资本市场体系将更加清晰完善、各组成部分联系更加紧密，资本市场服务实体经济的能力将进一步提升。
